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无菌室空气净化工程是属于生物净化工程的一种，一般无菌室要求的洁净度为万级，标准的微生物检测实验室都会专门开辟5~8个平方出来建造无菌室。无菌室应设有无菌操作间和缓冲间，无菌操作间洁净度应达到10000级，室内温度保持在20-24℃，湿度保持在45-60%。超净台洁净度应达到100级。无菌室应保持清洁，严禁堆放杂物，以防污染。无菌室应定期用适宜的消毒液灭菌清洁，以保证无菌室的洁净度符合要求。无菌室使用前必须打开无菌室的紫外灯辐照灭菌30分钟以上，并且同时打开超净台进行吹风。操作完毕，应及时清理无菌室，再用紫外灯辐照灭菌20分钟。无菌室应每月检查菌落数。在超净工作台开启的状态下，取内径90mm的无菌培养皿若干，无菌操作分别注入融化并冷却至约45℃的营养琼脂培养基约15ml，放至凝固后，倒置于30～35℃培养箱培养48小时，证明无菌后，取平板3～5个，分别放置工作位置的左中右等处，开盖暴露30分钟后，倒置于30～35℃培养箱培养48小时，取出检查。100级洁净区平板杂菌数平均不得超过1个菌落，10000级洁净室平均不得超过3个菌落。如超过限度，应对无菌室进行彻底消毒，直至重复检查合乎要求为止。
对于大部分洁净室、无尘室，为了防止外界污染侵入，需保持室内压力高于外部的压力，压力差的维持一般应符合：洁净空间的压力要高于非洁净空间的压力；相通洁净室之间的门要开向洁净度级别高的房间；洁净度级别高的空间的压力要高于相邻的洁净度级别低的空间的压力。
洁净空间的温湿度主要是根据工艺要求来确定的，在满足工艺要求的条件下，应考虑人的舒适感；温度对生产工艺的影响，主要是从产品精度和合格率来考虑的，另一方面也从污染角度考虑，因为温度升高后，会引起人出汗，汗水会对产品产生污染。湿度过高产生的问题也很多，如相对湿度超过55%以后，冷却水管壁面上会结露，如果发生在精密装置或电路中，就会引起各种事故，相对湿度在50%时易生锈。
为了保证洁净室内的环境符合生产要求，对室内一切设施、工装、工具、物品必须制定相关规定并检查确认，室内所有物品数量都应限制在最少的限度，并对物品的放置做出规定，尽量减少空气乱流，洁净室使用物品应先进行除尘处理，易产尘的物品不能带入洁净室内，净化房卫生定期清扫；对洁净室的洁净度、温度、湿度要进行监控、测试，及时进行调整超标参数。
洁净空间的温湿度主要是根据工艺要求来确定的，在满足工艺要求的条件下，应考虑人的舒适感；温度对生产工艺的影响，主要是从产品精度和合格率来考虑的，另一方面也从污染角度考虑，因为温度升高后，会引起人出汗，汗水会对产品产生污染。湿度过高产生的问题也很多，如相对湿度超过55%以后，冷却水管壁面上会结露，如果发生在精密装置或电路中，就会引起各种事故，相对湿度在50%时易生锈。
为了保证洁净室内的环境符合生产要求，对室内一切设施、工装、工具、物品必须制定相关规定并检查确认，室内所有物品数量都应限制在最少的限度，并对物品的放置做出规定，尽量减少空气乱流，洁净室使用物品应先进行除尘处理，易产尘的物品不能带入洁净室内，净化房卫生定期清扫；对洁净室的洁净度、温度、湿度要进行监控、测试，及时进行调整超标参数。