接种是最容易引起污染的环节，因此是食用菌工厂化生产中控制污染，确保成品率的环节。接种要求包括硬件与软件，应注意以下几方面：
① 接种室必须有空调设备，使室内温度保持18~20℃；
② 接种室的地面必须易于清理，用环氧树脂材料等无尘材料；
③ 接种时由于有栽培种传输至外操作区域，所以室内必须保持一定的正压状态，且新风的引入必须经过高效过滤，室内保持10000级，接种机区域保持100级；
④ 接种室必须安装紫外灯或臭氧发生器，对室内定期进行消毒、杀菌，紫外灯安装时注意角度和安装位置，使接种室消毒均匀周到；
⑤ 接种操作前后相关器皿、工具必须用75％的酒精擦洗、浸泡或火焰灼烧；
⑥ 接种操作的过程中人员必须按无菌操作要求进行。
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净化车间墙、顶板材料一般采用50mm厚的夹芯彩钢板、净化专用的氧化铝型材制造，门采用净化密闭门，窗采用铝合金玻璃固定窗；净化通风管道选用镀锌薄钢板制作，并采用“PEF”阻燃型的保温板做保温；地面采用环氧自流平或耐磨塑料洁净地板。
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